龟形石上的帕邦喀相传为文成公主初到拉萨的时候,依据八十种博唐数理及五行图推算,指出拉萨地形优胜、风水吉利,东为白龙、南为青虎、西为朱雀、北为玄武,玄武就是神龟。藏王松赞干布亲自到拉萨北郊视看,果然发现娘热山沟有一巨石如伏龟,高出地面有四、五层楼的样子。于是在这座龟形巨石上修筑一座宫堡,名叫帕邦喀,意为巨石堡。
有人说当时宫堡高有九层,四周全是用铁链固定的,石墙缝隙中也都浇铸了铁水,整座宫堡犹如铁桶般的坚固。后来松赞干布安置了吐蕃一位从南亚学习回来的名臣吞米·桑布扎在这里创制藏文,并且还拜他为规范师,亲自跟他学习文字。据说现在石头上刻的藏文六字真言便是吞米·桑布扎亲笔所书。在公元9世纪中期朗达玛灭佛后,这九层宫堡也毁于一旦。
但在公元11世纪时,著名僧人旁多哇和扎多哇又在废墟上修建了一座两层楼的寺庙,潜心研佛,静修佛法,深思佛道,并取名帕邦喀寺。此寺虽小,但是因为它的古老和佛学的精深,依然闻名全藏,乃至全国。如今这座寺庙已经修复,伫立于巨大龟石之上,风格独特,竟显敖人风姿,引来众多香客前来朝拜,因此香火尤盛。